Calca se encuentra en una plataforma situada a unos 2926 metros (9600 pies) sobre el nivel del mar, es decir 500 metros por debajo de Cusco, que tiene una altitud de 3400 metros. Como tal, goza de un clima más templado que la capital Inca.
El año en Calca se divide entre la estación de lluvias y la estación seca. La mayor parte de la lluvia ocurre desde octubre hasta marzo. De mayo a septiembre el clima es seco y cálido con cielos soleados
Aún cuando puede llover en cualquier estación, las tardes son soleadas y las noches son despejadas con estrellas muy visibles en el firmamento la mayor parte del año.
Durante el mes de julio pueden ocurrir repentinos pero cortos períodos de frío (friajes) en donde las temperaturas descienden ligeramente por debajo del punto de congelación.